Fondatrice de l’équipe Flaubert et du séminaire Flaubert du CAM (puis de l’ITEM), qu’elle a animés pendant de nombreuses années à l’ENS, Raymonde Debray Genette a marqué durablement les études flaubertiennes et dix-neuviémistes ainsi que la théorie littéraire par ses travaux en narratologie et en génétique, dont témoigne Métamorphoses du récit. Autour de Flaubert, paru au Seuil en 1988. Elle a publié l’anthologie critique Flaubert (dans la série Miroir de la critique, Didot-Didier 1970), et dirigé des volumes qui font date : Flaubert à l’œuvre (Flammarion, coll. « Textes et manuscrits », 1979) qui réunissait les premiers travaux de l’équipe Flaubert deux ans après sa fondation, et avec Jacques Neefs, Romans d’archives (Presses Universitaires de Lille, 1988) et L’Œuvre de l’œuvre. Études sur la correspondance de Flaubert (Presses Universitaires de Vincennes, 1993). Par sa participation, également, aux travaux des équipes Proust, Zola, Valéry, Raymonde Debray Genette a amplement contribué à la fécondité théorique et critique de l’étude des manuscrits d’écrivains.

Dès la création du Centre expérimental de Vincennes-Université Paris 8, elle a enseigné au département de Littérature française, et contribué à y développer la génétique et la théorie littéraire.